分公司注销清算的程序如下
一、注销公司国、地税登记证，再到公司主管工商局办理公司注销备案。所需资料
1、公司营来执照复印件。
2、公司股东会决议（就是注销公司，成立清算小组）。
3、公司原始档案。
4、到工商局领取表格此步办理时需要3个工作日，费用为65元（查档费用）
二、登报公告（登报45日后在去注销公司）。所需资料
1、公司营业执照复印件。
2、法定代表人身分证复印件。
3、公告（**公司，准备注销请各债权债务人自见报45日内到我公司清算小组办理债权债务事宜）注意（第一步和第二步可以同时办理）
三、登报45日后，再次到工商局办理注销申请。
法律依据
《中华人民共和国公司登记管理条例》第四十三条
公司申请注销登记，应当提交下列文件
（一）公司清算组负责人签署的注销登记申请书；
（二）人民法院的破产裁定、解散裁判文书，公司依照《公司法》作出的决议或者决定，行政机关责令关闭或者公司被撤销的文件；
（三）股东会、股东大会、一人有限责任公司的股东、外商投资的公司董事会或者人民法院、公司批准机关备案、确认的清算报告；
（四）《企业法人营业执照》；
（五）法律、行政法规规定应当提交的其他文件。
国有独资公司申请注销登记，还应当提交国有资产监督管理机构的决定，其中，国务院确定的重要的国有独资公司，还应当提交本级人民政府的批准文件。
有分公司的公司申请注销登记，还应当提交分公司的注销登记证明。
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