1、若当事人协商处理的，流程是协商赔偿数额、履行赔偿协议等；
2、若当事人调解或起诉的，流程是申请责任认定、医疗事故技术鉴定、赔偿款的确定、履行赔偿义务等。法律依据《医疗事故处理条例》第四十六条发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决；不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民法院提起民事诉讼。第二十条卫生行政部门接到医疗机构关于重大医疗过失行为的报告或者医疗事故争议当事人要求处理医疗事故争议的申请后，对需要进行医疗事故技术鉴定的，应当交由负责医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定；医患双方协商解决医疗事故争议，需要进行医疗事故技术鉴定的，由双方当事人共同委托负责医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定。《中华人民共和国民法典》第一千二百一十八条患者在诊疗活动中受到损害，医疗机构或者其医务人员有过错的，由医疗机构承担赔偿责任。
引用法规
《医疗事故处理条例》 第四十六条
《医疗事故处理条例》 第二十条
《中华人民共和国民法典》 第一千二百一十八条
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