存证的云合同有法律效力。只要该份云合同是经过双方当事人意思表示并达成一致，且各方当事人具有相应的民事行为能力，并且该云合同内没有违反法律法规及社会公序良俗的条款，就是具有法律效力的合同，受到法律的保护。但是云合同在证明力上可能会不及合同原件的证明力。所以建议妥善保管好合同原件。
根据《民法典》第一百四十三条的规定，具备下列条件的民事法律行为有效
（一）行为人具有相应的民事行为能力；
（二）意思表示真实；
（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
法律依据
《民法典》第一百四十三条
具备下列条件的民事法律行为有效
（一）行为人具有相应的民事行为能力；
（二）意思表示真实；
（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
引用法规
《民法典》 第一百四十三条
《民法典》 第一百四十三条
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