检察院批捕后不是一定会被公诉的。因为检察院在审查案件时，如果发现事实不清、证据不足、已经过了追诉期、犯罪情节显著轻微，不认为是犯罪的情形的话。检察院将不会提起公诉。
根据《刑事诉讼法》第一百七十一条的规定，人民检察院审查案件的时候，必须查明
（一）犯罪事实、情节是否清楚，证据是否确实、充分，犯罪性质和罪名的认定是否正确；
（二）有无遗漏罪行和其他应当追究刑事责任的人；
（三）是否属于不应追究刑事责任的；
（四）有无附带民事诉讼；
（五）侦查活动是否合法。
法律依据
《刑事诉讼法》第一百七十一条
人民检察院审查案件的时候，必须查明
（一）犯罪事实、情节是否清楚，证据是否确实、充分，犯罪性质和罪名的认定是否正确；
（二）有无遗漏罪行和其他应当追究刑事责任的人；
（三）是否属于不应追究刑事责任的；
（四）有无附带民事诉讼；
（五）侦查活动是否合法。
引用法规
《刑事诉讼法》 第一百七十一条
《刑事诉讼法》 第一百七十一条
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